16 Haziran 2026 tarihli Resmî Gazete’de yayımlanan Katma Değer Vergisi Genel Uygulama Tebliğinde Değişiklik Yapılmasına Dair Tebliğ (Seri No: 58) ile vergi uygulamalarında çok önemli değişikliklere gidildi. Hazine ve Maliye Bakanlığı (Gelir İdaresi Başkanlığı) tarafından yayımlanan tebliğle; vakıf üniversitesi hastanelerinin KDV muafiyet sınırlarından kamulaştırma işlemlerine, Darülaceze istisnalarından mazbut vakıflara kadar birçok alanda yeni kurallar belirlendi.
İşte öne çıkan kritik başlıklar:
1. Vakıf Üniversitesi Hastanelerine KDV Şoku (1 Ocak 2027’den İtibaren)
Yapılan düzenlemeyle, Cumhurbaşkanınca vergi muafiyeti tanınan vakıflar tarafından kurulan yükseköğretim kurumlarının (vakıf üniversitelerinin) işlettiği hastane, klinik, dispanser, kan bankası ve organ nakil bankası gibi sağlık kuruluşlarının sunduğu teslim ve hizmetler genel hükümler çerçevesinde KDV’ye tabi tutulacak.
- İstisnanın İstisnası: Eğer bu sağlık kuruluşları doğrudan doğruya üniversite tarafından değil de, vergi muafiyeti olan ana vakfın kendisi tarafından işletilirse KDV istisnası devam edecek. Bu madde 1 Ocak 2027 tarihinde yürürlüğe girecek.
2. Kamulaştırılan Taşınmazlara KDV İstisnası Geldi
2942 sayılı Kamulaştırma Kanunu kapsamında, kamu yararı bulunan hallerde taşınmazların Devlet ve kamu tüzel kişilerine devri KDV’den istisna edildi.
- Muhasebe Detayı: KDV mükelleflerine ait taşınmazlar kamulaştırıldığında KDV hesaplanmayacak. Ancak mükelleflerin bu taşınmazı alırken ödedikleri ve indirim konusu yaptıkları KDV, “Daha Önce İndirim Konusu Yapılan KDV’nin İlavesi” satırıyla indirim hesaplarından çıkarılacak. Bu tutar, gelir veya kurumlar vergisi matrahı tespit edilirken gider veya maliyet olarak yazılabilecek. (Geçerlilik tarihi: 1 Haziran 2026).
3. Darülaceze ve Mazbut Vakıflara KDV Kolaylığı
- Darülaceze: Tebliğde yapılan ibare değişiklikleriyle, Darülaceze bünyesinde yapılan teslim, hizmet ve bağış süreçleri de KDV istisnası ve özel uygulamalar kapsamına net bir şekilde dahil edildi.
- Mazbut Vakıflar: İbadethanelerin ve din eğitimi verilen tesislerin inşası/girişindeki KDV muafiyeti uygulamasına, Türkiye Diyanet Vakfı’nın yanı sıra Vakıflar Genel Müdürlüğü’nün yönettiği ve temsil ettiği “mazbut vakıflar” da eklendi.
4. İthalatta Teminatlı ÖTV ve KDV İadesi Düzenlemesi
Teminat karşılığı ithal edilen malların ihracı nedeniyle doğan KDV iade taleplerinde bürokrasi azaltılıyor. Doğrudan yüklenimler sebebiyle talep edilen tutarın azami iade edilebilir vergi tutarını aşan KDV kısmı için artık vergi inceleme raporu aranmadan genel esaslara göre iade talebi sonuçlandırılabilecek.
Yürürlük Tarihleri
Tebliğin vakıf üniversitesi hastanelerini ilgilendiren maddesi 1 Ocak 2027‘de, kamulaştırma ile ilgili maddesi 1 Haziran 2026‘dan geçerli olmak üzere bugün, diğer tüm maddeleri ise bugün (16 Haziran 2026) itibarıyla yürürlüğe girdi.
